Vào ngày 13 tháng 11 năm 2014, Mã Phát Tường đã nhảy lầu tự sát từ một tòa nhà tại khu liên hợp hải quân ở Công Chúa Phần, Bắc Kinh.[3] Ông đã bị Ủy ban Kiểm tra Kỷ luật Trung ương điều tra về tội tham nhũng, và cho rằng ông đã tự sát để tránh bị ô nhục và để gia đình nhận trợ cấp hưu trí của mình,[4] mặc dù nhận định ông tự sát do bị trầm cảm.[5] Việc tự sát của ông diễn ra sau vụ tự sát của Chuẩn đô đốc Khương Trung Hoa trong hoàn cảnh tương tự trước đó khoảng hai tháng.[3][5] Cuộc điều tra tham nhũng của Mã Phát Tường được cho là có liên quan đến vụ án của các cựu Phó Chủ tịch Quân ủy Trung ương, Từ Tài Hậu và Quách Bá Hùng.[5]

Tờ People's Navy, tờ báo chính thức của PLAN, thông báo rằng Mã Phát Tường đã qua đời vì bạo bệnh. Cáo phó chính thức gọi ông là "một Đảng viên Cộng sản xuất sắc và một chỉ huy chính trị xuất sắc của Hải quân". Vào ngày 1 tháng 12 năm 2014, thi thể của ông được hỏa táng tại Nghĩa trang cách mạng Bát Bảo Sơn. Nhiều lãnh đạo hải quân đương nhiệm và cựu lãnh đạo hải quân, bao gồm Tư lệnh Ngô Thắng Lợi và Chính ủy Lưu Hiểu Giang, đã tham dự buổi lễ, nhưng các lãnh đạo cấp cao của Đảng và chính phủ Cộng sản đều vắng mặt đáng kể.[1]